کاربرد توصیف گرهای مولکولی برای مدل سازی های چند متغیره خصوصیات ترکیبات نیترو آروماتیکی مبتنی بر ساختار الکترونی مولکولی

پایان نامه
چکیده

یکی از گروه های مهم از لحاظ اقتصادی ترکیبات نیترو آروماتیکی هستند که در ردیف مهمترین مواد اولیه و محصولات شیمی صنعتی قرار می گیرند. از این ترکیبات برای تهیه ی داروها، کودهای شیمیایی، رنگ های نساجی و مواد منفجره استفاده می شود. سری داده ها شامل مجموعه ای از انواع مختلف ترکیبات نیترو آروماتیکی است که برای توسعه ی مدل های روابط کمی ساختار-خاصیت برای پیش بینی مقادیر ثابت سرعت های احیایی شامل ثابت سرعت های کاتالیزوری (kcat) و دو مولکولی (kcat/km) به وسیله ی آنزیم کینون اکسیدوردوکتاز nqo1 استفاده می شود. مدل سازی ها با استفاده از رگرسیون خطی چند متغیره (mlr) و رگرسیون اجزای اصلی (pcr) انجام می شود. در رگرسیون خطی چند متغیره، ابتدا توصیف گرهای ساختاری بر اساس نرم افزار دراگون دسته بندی می شوند، سپس انتخاب مرحله ای روی هر گروه انجام می شوند (mlr1)، یکبار هم انتخاب مرحله ای روی تمام توصیف گرهای محاسبه شده اعمال می شود (mlr2). به شیوه ای مشابه، توصیف گرهای ساختاری برای مدل سازی های pcr به کار گرفته می شوند، ابتدا مبتنی بر انتخاب اجزای اصلی از هر کدام از دسته های مختلف توصیف گرها (pcr1) و در مرحله بعدی انتخاب اجزای اصلی بر اساس مجموعه کل توصیف گرها (pcr2). در هر دو مرحله تعداد اجزای اصلی به صورتی می باشند که بیشتر از 95% واریانس کل داده ها را در بر داشته باشند. مدل های ایجاد شده با استفاده از ارزیابی تقاطعی ( یکی را در بیرون گذاشتن) و ارزیابی خارجی (کالیبراسیون-پیش بینی) مورد ارزیابی قرار می گیرند. هر دو روش mlr نتایج دقیقی نشان می دهند هر چند مدل های qspr ایجاد شده توسط mlr1 از جنبه ی آماری با اهمیت تراز mlr2 می باشند. روش pcr1 نسبت به تمام روش ها، نتایج دقیق تری به دست می دهد در حالیکه نتایج حاصل از روش pcr2بسیار ضعیف تر می باشد. به طور کلی ضرایب همبستگی ارزیابی تقاطعی و پیش بینی حاصل از روش های mlr1و mlr2 و pcr1 نزدیک به %90 می باشد که بیان گر توانایی بالای این روش ها در پیش بینی و ارزیابی ثابت های سرعت مورد مطالعه می باشد.

۱۵ صفحه ی اول

برای دانلود 15 صفحه اول باید عضویت طلایی داشته باشید

اگر عضو سایت هستید لطفا وارد حساب کاربری خود شوید

منابع مشابه

توسعه و کاربرد روش های آماری چند متغیره در مدل سازی مولکولی و اندازه گیری ترکیبات دارویی

در این پژوهش، از روش¬های آماری چند متغیره در مدل¬سازی مولکولی و اندازه¬گیری ترکیبات دارویی بهره گرفته شد. در بررسی اول، مطالعه رابطه ساختار فعالیت بر روی ترکیبات شبه دارویی quinoline انجام شد. روش¬های انتخاب متغیرهای مختلف مورد بررسی قرار گرفتند و بهترین نتایج توسط مدل erm-pls به¬دست آمد و از آن در جهت پیش¬بینی و همچنین غربالگری رایانه¬ای و طراحی داروهای جدید استفاده شد. در بررسی دوم مطالعه qsa...

خواص ترابرد الکترونی یک زنجیره ی چند مولکولی فتالوسیانین مس

در این تحقیق با استفاده از روش تابع گرین در رهیافت تنگابست به مطالعه‏ی ترابرد الکترونی یک سامانه ی چند مولکولی فتالوسیانین مس متصل دو هادی فلزی پرداخته شده است. نتایج نشان می دهد که در گاف های این سامانه چگالی حالت های الکترونی مستقل از تعداد مولکول ها یا طول سامانه رفتار می‏کند. همچنین افزایش طول سامانه علاوه بر کاهش رسانش تونل زنی، باعث ظهور دره ها و قله هایی در گاف های طیف رسانش می شود و بست...

متن کامل

پیشگویی سمیت و ضریب توزیع اکتانول-آب آفت کش‌های آلی کلردار با استفاده ازتوصیف گرهای مولکولی و روش‌های الگوریتم ژنتیک و رگرسیون خطی چند متغیره

در این تحقیق ازمطالعه ارتباط کمی ساختار- فعالیت (QSAR) جهت پیشگویی فعالیت­های آفت کش­های آلی کلردار استفاده شد. ابتدا به کمک نرم‌­افزارگوس ویو 05 ساختار شیمیایی تمام مولکول‌­های مورد مطالعه رسم گردید و سپس بهینه­سازی با نرم‌افزار گوسین 09 و روش هارتری-فاک و سری پایه G* 31-6 انجام پذیرفت. خواص فیزیکی- شیمیایی نظیر سمیت(logLD50)  وضریب توزیع اکتانول-آب (logP) از منابع معتبر علمی به­دست...

متن کامل

مروری بر کاربرد روش‌های تایپینگ مولکولی در گونه های آسپرژیلوس

Conidia of Aspergillus species are widely distributed and ubiquitous in outdoor and hospital environments. There are high numbers of patients with weakened immune systems, therefore Aspergillus infections are increasing in hospitals. Molecular typing of Aspergillus strains obtained from patients and their environment is an important tool for epidemiological and public health studies. Fingerprin...

متن کامل

مروری بر توصیف کننده های مولکولی مواد پرانرژی در مدل های ارائه شده برمبنای qsar/qspr

چکیده: آگاهی از ساختار مولکولی کلید فهم عملکرد مولکولهاست و این به دلیل ارتباطی است که بین ساختار و ویژگی های یک ترکیب وجود دارد و خواص ماکروسکوپی و میکروسکوپی آن را به هم مرتبط می کند. انجام بسیاری از کارهای آزمایشگاهی نیازمند صرف وقت و هزینه ی بسیار می باشد. qspr روشی است که امکان دستیابی به داده ها و اطلاعات مورد نظر را با صرف حداقل وقت و هزینه فراهم می آورد. از آنجا که تحقیقات آزمایشگاهی بر...

متن کامل

مدل سازی و ارزیابی اثر تغییر ساعت رسمی بر مصرف برق به کمک شبیه سازی مبتنی بر رگرسیون های چند متغیره ظاهراً نامرتبط

هدف اصلی این مقاله بررسی اثر تغییر ساعت بر مصرف برق است. در این مقاله مدلی توسعه داده شده است و به کمک آن اثر تغییر ساعت بر مصرف برق در ناحیه تحت پوشش استان تهران تجزیه و تحلیل شده است. رهیافت تجزیه و تحلیل در این مقاله، رهیافت شبیه سازی مبتنی بر مدلهای رگرسیون چند متغیره است. مدل رگرسیونی استفاده شده در این مقاله، سیستمی از 24 معادله رگرسیونی چند متغیره است که بوسیله روش رگرسیونهای ظاهراً نام...

متن کامل

منابع من

با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید

ذخیره در منابع من قبلا به منابع من ذحیره شده

{@ msg_add @}


نوع سند: پایان نامه

وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه کردستان - دانشکده علوم پایه

میزبانی شده توسط پلتفرم ابری doprax.com

copyright © 2015-2023